1、菌丝不吃料。接进去的母种或原种菌丝块的菌丝不萌发，有些虽然萌发了，但不长入料内，以后逐渐萎缩变黄。可能由下列原因引起：（1）培养料堆制发酵不好，发酵时温度不高，或者每次翻堆都加粪水，造成臭气重，氨气浓。（2）培养料过干，菌丝不能长进料中。（3）接种消毒时，箱内（或接种室内）熏蒸药量过高或湿度过高，致使菌丝死亡。（4）高压灭菌以后，菌种瓶内的培养基尚未冷却即接种。（5）接入的母种或原种长期在不良环境条件下贮藏，已经衰老，生活力极差。

    2、“断菌”、“退菌”、“吐黄水”。如培养料堆制发酵不够，装瓶过松，萌发出来的菌丝细弱无力；温度高，通风不良，造成菌丝萎缩，这叫做“退菌”。如培养料腐熟过度，含水量过高，温度过高，就会发生菌丝断裂现象，称作“断菌”。后期在菌种瓶内出现黄色液体，这叫做“吐黄水”。

    二、栽培中的问题

    覆土后至出菇前：

    1、培养料表面菌丝萎缩。主要是由于喷水过多过急，造成湿度大，水流到培养料中，致使菌丝生长受阻。此时应减少或停止喷水，并在培养料底部戳洞，加强通风，使菌丝迅速恢复正常生长。

    2、菌丝徒长（冒菌丝）。在气温高，菇房通气少，并在细土上加一层薄薄的干细土，待温度降低后，连续喷几次水，使上层表面形成较密、较小的子实体。

    3、结菌块。在培养料腐熟过度、湿度大、温度高和通气不良的情况下，培养料表面或土层上出现一簇簇短而密的菌丝，随后板结成块，包围着粗细土粒。出现这种现象可将培养料表面或土粒周围的菌块去掉，并轻轻弄松料层，注意水分管理，防止过干或过湿。

    4、胡桃肉状菌。此菌多在覆土以后，出菇之前发生。在高温、高湿，通风差的环境条件下，容易发生和蔓延。这种菌发生时，先在细土之间产生浓密的白色菌丝，然后出现胡桃肉状一粒一粒的菌核。发生此菌的地方不出蘑菇。一般的防治方法是播种时细心挑选菌种，不要采用有胡桃肉状菌核和漂白粉气味的菌种。播种不宜过早，培养料不宜过湿。如已发生这类杂菌，应立即停止喷水，使土面干燥，并及时挑掉菌落，待温度降低到16℃以下，再喷水管理。